乙醛酸循環在植物種子中有特別意義。它使萌發的種子將貯存的三醯甘油通過乙醯-CoA轉變為葡萄糖。
2 乙醯-CoA + 2 NAD+ + FAD → 草醯乙酸 + 2 CoA-SH + 2 NADH + FADH2 + 2 H+