①含有多個限制酶切點。每種酶的切點最好只有一個,如大腸桿菌pBR322就有多種限制酶的單一識別位點,可適於多種限制酶切割的DNA插入 ②有一定的標記基因,便於進行篩選。如大腸桿菌的pBR322質粒攜帶氨苄青黴素抗性基因和四環素抗性基因,就可以作為篩選的標記基因。一般來說,天然載體往往不能滿足上述要求,因此需要根據不同的目的和需要,對載體進行人工改建。現在所使用的質粒載體幾乎都是經過改建的。